決策者和公眾之間一直在爭論SARS-CoV-2來自何處。盡管研究人員認(rèn)為蝙蝠是SARS-CoV-2最可能的自然宿主，但病毒的起源仍不清楚。

在5月10日的《當(dāng)前生物學(xué)》雜志上，研究人員描述了一種最近鑒定出的蝙蝠病毒，它是SARS-CoV-2在基因組某些區(qū)域中最接近的親戚，并且在病毒S1和S2亞基的交界處含有氨基酸插入。以類似于SAR-CoV-2的方式刺入蛋白質(zhì)。研究人員說，盡管它不是SARS-CoV-2的直接進(jìn)化前體，但這種新病毒RmYN02表明，這些類型看似不尋常的插入事件可以在病毒進(jìn)化中自然發(fā)生。

中國山東第一醫(yī)科大學(xué)病原生物學(xué)研究所所長兼教授史偉峰說：“自從發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2以來，已有許多沒有根據(jù)的建議表明該病毒是實(shí)驗(yàn)室來源的?！薄疤貏e是，有人提出，S1 / S2插入非常不尋常，可能表明實(shí)驗(yàn)室在操縱。我們的論文非常清楚地表明，這些事件是自然發(fā)生在野生動(dòng)植物中的。這提供了有力的證據(jù)證明SARS-CoV-2是實(shí)驗(yàn)室逃逸的。”

研究人員通過對2019年5月至10月間在中國云南省收集的227個(gè)蝙蝠樣本進(jìn)行分析而確定了RmYN02?！白詮?005年發(fā)現(xiàn)蝙蝠是SARS病毒的宿主以來，人們就對蝙蝠作為宿主物種產(chǎn)生了濃厚的興趣。尤其是因?yàn)樗鼈償y帶高度多樣的RNA病毒，包括病毒，”他說。在發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2之后不久，樣本中的RNA于2020年1月初被送去進(jìn)行宏基因組的下一代測序。

在整個(gè)基因組中，與SARS-CoV-2最接近的是另一種稱為RaTG13的病毒，該病毒先前是從云南省的蝙蝠中發(fā)現(xiàn)的。但是，在這里新發(fā)現(xiàn)的病毒RmYN02在基因組的某些部分與SARS-CoV-2更加緊密相關(guān)，包括在基因組中最長的編碼部分1ab中，它們共享97.2%的RNA。研究人員指出，RmYN02在編碼關(guān)鍵受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的基因組區(qū)域中與SAR-CoV-2并不十分相似，該結(jié)合域與SARS-CoV-2用于感染宿主細(xì)胞的人ACE2受體結(jié)合。這意味著它不太可能感染人體細(xì)胞。

SARS-CoV-2與RmYN02之間的關(guān)鍵相似之處在于，發(fā)現(xiàn)RmYN02在其刺突蛋白的兩個(gè)亞基相遇的位置也含有氨基酸插入。SARS-CoV-2的特征是在S1和S2的連接處插入了四個(gè)氨基酸。這種插入是該病毒特有的，迄今為止已存在于所有SARS-CoV-2測序中。RmYN02中的插入與SARS-CoV-2中的插入不同，這表明它們是通過獨(dú)立的插入事件發(fā)生的。但是，在蝙蝠中識別出的病毒中發(fā)生的類似插入事件強(qiáng)烈表明，這類插入是自然起源的。